
Заведующий лабораторией
Егоров Владимир Валерьевич, доктор биологических наук
Краткая история создания лаборатории
Основные направления исследований
-
Идентификация микроорганизмов методом масс-спектрометрииизучения микробиома человека и биоразнообразия;
-
Идентификация природных белков в рамках изучения молекулярных механизмовпатогенеза социально значимых заболеваний;
-
Контроль качества рекомбинантных и природных белков, полученных дляиспользования в качестве диагностических и профилактических средств;
- Изучение протеома бактерий для определения механизма действия антибиотиков;
- Контроль качества химически синтезированных пептидов;
- Исследования в области интерактомики и структурной биологии.
Основные научные результаты за последние 5 лет
- Найден ряд новых белковых факторов, отвечающих за формирование матрикса у Bacillus;
-
Определён структурный домен белка NS1 вируса гриппа, отвечающий за егоприоноподобную олигомеризацию;
-
Определена молекулярная мишень потенциального антибиотика, действующего на рядпатогенных штаммов микроорганизмов;
-
Проведена идентификация более 20000 штаммов бактерий в рамках исследованиймикробиома человека и животных, биоразнообразия;
-
Разработаны протоколы исследования рекомбинантных белков и проект паспортарекомбинантного белка.
Сотрудники лаборатории:
Иванова Надежда Сергеевна, инженер
Масс-спектрометрия высокого разрешения с электрораспылением, обработка результатов масс-спектрометрического анализа.
Наиболее значимые публикации и разработки за последние 5 лет:
-
Ivanova LA, Egorov VV, Zabrodskaya YA, Shaldzhyan AA, Baranchikov AY,Tsvigun NV, Lykholay AN, Yapryntsev AD, Lebedev DV, Kulminskaya AA. Matrixis everywhere: extracellular DNA is a link between biofilm and mineralization inBacillus cereus planktonic lifestyle. NPJ Biofilms Microbiomes. 2023 Feb 28;9(1):9.doi: 10.1038/s41522-023-00377-5. PMID: 36854956; PMCID: PMC9975174.
-
Egorov V.V., Shvetsov A.V., Pichkur E.B., Shaldzhyan A.A., Zabrodskaya Y.A.,Vinogradova D.S., Nekrasov P.A., Gorshkov A.N., Garmay Y.P., Kovaleva A.A.,Stepanova L.A., Tsybalova L.M., Shtam T.A., Myasnikov A.G., Konevega A.L. Insideand outside of virus-like particles HBc and HBc/4M2e: A comprehensive study of thestructure // Biophysical Chemistry. – 2023 – V. 293 – P. 106943
-
Zabrodskaya Y.A., Egorov V.V., Sokolov A.V., Shvetsov A.V., Gorshkova Y.E.,Ivankov O.I., Kostevich V.A., Gorbunov N.P., Ramsay E.S., Fedorova N.D.,Bondarenko A.B., Vasilyev V.B. Caught red handed: modeling and confirmation ofthe myeloperoxidase ceruloplasmin alpha-thrombin complex // Biometals. – 2022 –V. 35 – № 6 – P. 1157-1168.
-
Shaldzhyan A.A., Zabrodskaya Y.A., Baranovskaya I.L., Sergeeva M.V., GorshkovA.N., Savin I.I., Shishlyannikov S.M., Ramsay E.S., Protasov A.V., Kukhareva A.P.,Egorov V.V. Old dog, new tricks: Influenza a virus NS1 and in vitro fibrillogenesis //Biochimie. – 2021 – V. 190 – P. 50-56.
-
Antimonova O.I., Grudinina N.A., Ilyin V.V., Polukeev V.A., Shavlovsky M.M.,Zabrodskaya Y.A., Shabalin K.A., Yakimov A.P., Ramsay E.S., Protasov A.V.,Egorov V.V. Time machine: Can a dye from 1928 be re-purposed for modern,fluorescence-based detection of amyloid-like fibrils? // Dyes and Pigments. – 2020 –V. 172 – P. 107863
-
Antimonova O.I., Lebedev D.V., Zabrodskaya Y.A., Grudinina N.A., TimkovskyA.L., Ramsay E., Shavlovsky M.M., Egorov V.V. Changing times: fluorescence-lifetime analysis of amyloidogenic sf-iapp fusion protein // Journal of StructuralBiology. – 2019 – V. 205 – № 1 – P. 78-83.
Сотрудники лаборатории

Бердичевский Григорий Михайлович
Сфера научных интересов: Обеспечения медицинской клинической лабораторной диагностики платформой для высокоточных измерений на базе метода хромато-масс-спектрометрии с изотопным разбавлением, массовый и селективный скрининг наследственных болезней обмена, разработка и внедрение новых методик анализа различных метаболитов человека на базе методов хроматографии и хромато-масс-спектрометрии

Иванова Надежда Сергеевна
Сфера научных интересов: Фолдинг белка, биотехнологии, факторы патогенности микроорганизмов, моделирование молекулярной динамики в GROMACS, атомно-силовая микроскопия, масс-спектрометрическое типирование бактерий.