Лаборатория функциональной геномики и протеомики микроорганизмов

Заведующий лабораторией

Гончаров Артемий Евгеньевич,
доктор медицинских наук, доцент

e-mail: microbio@iemspb.ru

Краткая история лаборатории

Лаборатория создана в 2008 году.

Основные направления исследований

Основными объектами исследований являются патогенные и условно-патогенные стрептококки — возбудители инфекционных заболеваний человека и животных.

Основные направления исследований:

  • геномный полиморфизм патогенных бактерий;
  • разработка методов молекулярной диагностики возбудителей;
  • механизмы регуляции транскрипции генов и экспрессии белков микроорганизмов;
  • создание на основе стрептококковых белков уникальных сорбентов и диагностических наборов для выявления содержания в биологических жидкостях человека альбумина и иммуноглобулинов различных классов.

Основные научные результаты за последние 5 лет

Наиболее значимые результаты, полученные за последние годы:

  • разработаны новые молекулярные подходы для дифференциальной генодиагностики эпидемически актуальных клонов стрептококков различных видов (S. agalactiae, S. pyogenes, S. pneumoniae, S. dysgalactiae, S. uberis, S. mutans, S. constellatus, S. equisimilis);
  • построены генетические карты штаммов стрептококков, обнаружены ранее неизвестные гены вирулентности и «островки патогенности» и выявлены новые маркеры для установления степени генетического родства штаммов;
  • изучены механизмы регуляции экспрессии генов вирулентности S. pyogenes (белками-регуляторами Rgg, MutR), S. agalactiae (двухкомпонентной системой BgrR/S), S. mutans (белком-регулятором CovR) и их влияние на патогенные свойства стрептококков.

Цикл работ по изучению механизмов регуляции экспрессии генов у патогенных стрептококков удостоен премии принца Ольденбургского.

С участием д.б.н. Т.В. Гупаловой разработан принцип рецепторно-ферментного анализа, а на его основе —высокочувствительный метод. Метод особенно востребован к клинической практике для оценки состояния и прогноза развития возможных поражений почек у больных сахарным диабетом на фоне микроальбуминурии. Создана и апробирована экспериментальная диагностическая тест-система, а также штаммы-продуценты полипептидов, связывающих альбумин и иммуноглобулин G.

Сотрудники лаборатории

Гупалова Татьяна Виталиевна

доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник

Сфера научных интересов: Общая и молекулярная микробиология, биохимия и генетика микроорганизмов, протеомика, структура и функция белков, генно-инженерные технологии, биотехнология

Бормотова Елена Алексеевна

научный сотрудник

Сфера научных интересов: Биотехнология, рецепторные белки

Никитенко Нина Андреевна

научный сотрудник

Сфера научных интересов: Противоопухолевые бактерии, стрептококки группы А, молекулярная биология, рекомбинантные продуценты